В целях совершенствования системы бухгалтеоской и финансовой отчетности и приведения ее в соответствие с Международными стандартами финансовой отчетности (МСФО) Указом Президента Кыргызской Республики № 73 "О мерах по реформированию системы бухгалтерской и финансовой отчетности в Кыргызской Республике" 3 апреля 2000 года образована Национальная комиссия по стандартам финансовой отчетности Кыргызской Республики при Президента КР.

28 декабря 2000 года Указом Президента КР № 363 "О реорганизации центральных органов управления" Национальная комиссия по стандартам финансовой отчетности и аудиторской деятельности при Президенте Кыргызской Республики была преобразована в Государственную комиссию при Правительстве Кыргызской Республики по стандартам финансовой отчетности и аудиту.

28 сентября 2001 года в качестве стандартов финансовой отчетности в Кыргызской Республике постановлением Правительства Кыргызской Республики от № 593 "О Международных стандартах финансовой отчетности в Кыргызской Республике") были приняты Международные стандарты финансовой отчетности (МСФО) и разработан график перехода юридических лиц на МСФО.

22 апреля 2003 года Постановлением Правительства Кыргызской Республики №235 "О Международных стандартах аудита в Кыргызской Республики" были приняты Международные стандарты аудита в Кыргызской Республике (МСА).